Algunas de las enfermedades que afectan al durazno son la cloca y el tiro de munición causadas por hongos principalmente en la zona central. Se recomienda el uso de fungicidas cúprico antes de que se hinchen sus yemas. Si estas enfermedades se manifiestan cuando ya ha brotado, es necesario recurrir a fungicidas que no tengan efecto tóxico, como los ditiocarbonatos. En cuanto a plagas, lo atacan la escama de San José, que afecta a todos los árboles frutales de la hoja caduca, ocasionando un debilitamiento general del árbol. Para controlar se deben utilizar productos organofosforados, como emulsión, reforzado con aceite mineral. El pulgón verde del duraznero daña al fruto pequeño y los brotes epicales ( de las puntas de las ramas) y deforma las hojas. En este caso se deben usar insecticidas organofosforados o carbamatos.
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